La production traditionnelle de l'indigo s'effectuait sur plusieurs mois. Les feuilles d'Isatis Tinctoria, récoltées en automne, étaient broyées dans un moulin avec de l'eau. La pâte obtenue était modelée en boules d'environ 15 cm de diamètre. Ces cocagnes étaient stockées en plein air pendant environ 2 mois.
Au cours de cette lente maturation, une transformation enzymatique permettait de produire l'indoxyle à partir de l'isatan B.
Les coques étaient ensuite broyées finement avec de la chaux et de l'urine. L'indigo, formé par la consensation de deux molécules d'indoxyle, était réduit par l'urée en milieu basique sous sa forme soluble: le leucoindigo. La pâte obtenue (qui a donné son nom au pastel) était prête à l'emploi. Il ne restait plus au teinturier qu'à la dissoudre dans de l'eau chaude pour préparer le bain de teinture.
L'indigo, en tant que pigment, était un sous produit des bains de teinture. Il était récupéré dans la mousse qui se formait sur le bord de la cuve.